A szexfüggő színész és felesége egyszer már szakítottak, 2009-ben újra összejöttek, de most ismét válságba került kapcsolatuk – a TMZ értesülései szerint. A lapnak egy Duchovnyhoz közeli forrás árulta el, hogy bár a színész épp nincs jóban Tea Leonival, még nem adták be a válókeresetet. A pár 1997-ben házasodott össze, 2008-ban váltak el, 2 gyermekük van.