Brendan Fraser kilenc évnyi házasság után elvált feleségétől, Aftontól, írja a Starmagazine. Sajtósuk költői megfogalmazása szerint "közeli és gondoskodó barátságuk továbbra is megmarad". Fraser és felesége 1998-as házasságkötésük óta három gyermekkel (Griffin, Holden és Leland) büszkélkedhetnek.