Matt Damonnak összesen három gyereke van. Kettő feleségétől, Luciana Barrosótól a 3 éves Gia és a 14 hónapos Stella, valamint nevelőapja még felesége korábbi házasságából született lányának, a 12 éves Alexiának. Damon mostanában azt mondogatja interjúiban, hogy életében a családja a legfontosabb, amikor a Vanity Fair arról kérdezte, hogy mikor volt a legboldogabb, akkor is a csládjával példálózott félig viccesen. "A legboldogabb akkor voltam, amikor a gyerekeket csináltuk az ágyban, meg amikor megszülettek a kórházban" - mondta a színész a lapnak.